A kongregációt XV. Benedek pápa hozta létre 1917-ben. Ferenc pápa homíliájában hangsúlyozta, hogy a két intézmény az első világháború idején jött létre.

"Ma - ahogyan már többször elmondtam - egy újabb világháborúban élünk" - jelentette ki a katolikus egyházfő arra utalva, hogy a világ különböző részein, de egy időben pusztító konfliktusok zajlanak. Hozzátette, hogy ezeknek áldozatai között vannak a keleti egyházak hívői, akik "drámai üldözést szenvednek el, és szétszóródásuk egyre aggasztóbb méretet ölt".

A kongregációhoz intézett üzenetében Ferenc pápa kiemelte, a keresztények üldözése felett "senki sem hunyhat szemet".

Az egyházfő megválasztása óta többször hangoztatta meggyőződését, amely szerint még a keresztényüldözések első évszázadaiban sem haltak annyian mártírhalált, mint ma.

A Keleti Egyházak Kongregációja a pápai misével zárta a Vatikánban rendezett éves közgyűlését, amelyen a kongregáció tagjaként részt vett Erdő Péter bíboros, prímás, valamint Kocsis Fülöp görög-katolikus érsek, a hajdúdorogi főegyházmegye metropolitája is.